Mert Baykal 1979 yılında İstanbul’da dünyaya gelmiştir.
Bilgi üniversitesi Sinema ve Televizyon Bölümü’nde 1 sene okumuş ardından Amerika’da Geogre Mason Üniversitesi Sinema Televizyon Bölümü’nden mezun olmuştur.
Tiyatro oyuncusu Oya İnci Mert Baykal ‘ın teyzesidir. Annesi Derya Baykal, babası ise Levent Baykal’dır. Annesi Derya Baykal’ın Ferhan Şensoy ile evliliğinden Müjgan ve Derya Şensoy isimlerinde iki kız kardeşi vardır.
Amerika’da 4 sene kalan Baykal burada sinema prodüksiyon eğitimi almış ardından İstanbul’a dönüş yaparak Sinan Çetin’in asistanlığını yapmaya başlamıştır.
Günümüzde Zihin Açıklığı isimli bir film şirketi bulunmaktadır. 2012 yılında Berna Parlak ile evlenmiş, bu evliliğinden 2013 doğumlu Ali isminde bir oğlu vardır.
Pardon, Ah Polis Olsam, Muhteşem Yüzyıl 4. Sezon, Kardeşim Benim, Muhteşem Yüzyıl Kösem ve Fİ Çİ Pİ isimli sinema ve dizilerin yönetmenliğini yapmıştır. Ayrıca Romantik sinema filmi yönetici ekibinde yer almış, Pardon isimli Kurgu sinema filminin yönetmenliği ve Pardon, Varsayalım İsmail ile Soyut Padişah’da oyuncu olarak yer almıştır.
