Profesyonel futbol kariyerine 1991 yılında Soma Linyitspor takımı ile başlamış ardından Altay, Beşiktaş, Fenerbahçe, Aston Villa, İncheon United, Urawa Red Diamonds ve 1. FC Köln takımlarında forma giymiştir.
Kariyerinin en parlak dönemini Beşiktaş forması ile yaşamıştır. Alpay Özalan Türkiye U-21 formasını 23, Türkiye A Milli Takım formasını ise kariyerinde 102 kez giymiştir. A Milli forma altında 4 gole imza atmıştır.
Futbol kariyerinin ardından teknik direktör olarak devam etmiş, 2016 yılında Eskişehirspor, 2017 yılında ise Samsunspor takımlarını çalıştırmıştır.
1973 doğumlu Alpay Özalan aslen İzmir’lidir ve İzmir’de dünyaya gelmiştir. Eski manken Cansel Özzengin ile evlidir ve bu evliliğinden 2 çocuğu vardır. İkizler burcudur.
2018 yılında AK Partiden Milletvekili aday adayı olacağı yönünde haberler ile gündeme gelmiştir.
Bildiğim kadarıyla Ordulu’dur.